O rio Lençóis é um rio brasileiro do estado de São Paulo.

O Rio Lençóis é um tributário do rio Tietê e banha vários municípios, entre eles o município de Lençóis Paulista. Aí nesta cidade atravessa a região urbana, servindo de manancial de abastecimento.

No dia 14 de fevereiro de 2006, o rio Lençóis enfrentou a sua maior enchente já registrada em toda a história. Subindo mais de 8 metros devido ao estouro de 4 represas (3 da cidade vizinha de Borebi). Muitas casas nas regiões ribeirinhas foram atingidas, o comércio e o SAAE também foram atingidos, os prejuízos foram de R$ 300,000,00.

A água passou por cima das pontes que cortam a cidade, chegando ao Museu Alexandre Quitto, alagando toda a Rua 25 de Janeiro.